Cotizaciones durante una licencia médica: quién las paga y cómo se calculan

Cuando una persona trabajadora presenta una licencia médica en Chile, una de las dudas más frecuentes es qué ocurre con sus cotizaciones previsionales mientras permanece temporalmente sin trabajar. Es común pensar que, al dejar de recibir la remuneración habitual y pasar eventualmente a recibir un Subsidio por Incapacidad Laboral (SIL), las cotizaciones se suspenden. Sin embargo, la regla general es distinta: durante los períodos de incapacidad laboral deben mantenerse las cotizaciones que correspondan, aunque la responsabilidad de pagarlas puede distribuirse entre la entidad pagadora del subsidio y el empleador.

Además, desde la implementación gradual de la reforma previsional existen nuevos aportes de cargo del empleador que también deben considerarse. Por ello, no basta con revisar únicamente la cotización del 10% para pensiones y el 7% de salud: dependiendo del contrato, el origen de la licencia, la duración del reposo y el período involucrado también pueden intervenir el Seguro de Cesantía, el Seguro Social Previsional, la Cotización con Rentabilidad Protegida y otras cotizaciones de cargo del empleador.

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Introducción al tema

Una licencia médica cumple principalmente dos funciones. Primero, permite justificar legalmente la ausencia de una persona trabajadora cuando existe una incapacidad temporal para desempeñar sus funciones. Segundo, si se cumplen los requisitos legales y previsionales, puede generar el derecho a recibir un Subsidio por Incapacidad Laboral que reemplaza total o parcialmente los ingresos que la persona deja de percibir durante el reposo.

La existencia del subsidio no significa que las obligaciones previsionales desaparezcan. El sistema contempla mecanismos destinados a evitar que una enfermedad, accidente, embarazo u otra situación protegida produzca automáticamente una laguna en las cotizaciones de pensión y salud.

La Superintendencia de Seguridad Social establece que durante los períodos de incapacidad laboral deben enterarse las cotizaciones correspondientes y que, para pensiones y salud, la referencia general es la última remuneración o renta imponible del mes anterior al inicio del reposo, o la remuneración estipulada en el contrato cuando no exista dicha base.

Este punto es especialmente importante porque la base utilizada para pagar las cotizaciones durante una licencia médica no necesariamente coincide con el monto del subsidio que recibe el trabajador. Son cálculos relacionados, pero jurídicamente diferentes.

A lo largo de este artículo se explica quién paga las cotizaciones durante una licencia médica, qué ocurre si la licencia cubre todo el mes o solamente algunos días, cómo se determina la base imponible, qué sucede con AFP, salud y Seguro de Cesantía, cómo influyen los nuevos aportes previsionales de 2026 y qué documentos conviene revisar cuando aparecen diferencias.

Información principal

Qué ocurre con las cotizaciones mientras una persona está con licencia médica

La regla general es que una licencia médica autorizada no elimina por sí sola la obligación de mantener la continuidad previsional de la persona trabajadora. Durante el período de incapacidad laboral existen cotizaciones que debe enterar la entidad pagadora del subsidio y otras que siguen siendo responsabilidad del empleador.

Por esta razón, al revisar una cartola previsional correspondiente a un mes en que existió licencia médica, puede aparecer información proveniente de más de un pagador. Por ejemplo, una parte puede corresponder al empleador por los días efectivamente trabajados y otra a la institución que pagó el Subsidio por Incapacidad Laboral.

Dependiendo de la situación, la entidad pagadora puede ser una Caja de Compensación de Asignación Familiar, una Isapre, una entidad asociada al régimen Fonasa, una mutualidad de empleadores, el Instituto de Seguridad Laboral u otro organismo competente.

Por eso no debe interpretarse automáticamente como un error el hecho de que el nombre del empleador no aparezca como pagador de todas las cotizaciones correspondientes a un mes con licencia.

La licencia médica y el subsidio no son exactamente lo mismo

Conviene separar tres conceptos:

• Licencia médica: documento que certifica una incapacidad temporal y prescribe un período de reposo.
• Autorización de la licencia: pronunciamiento de la institución competente respecto del reposo indicado.
• Subsidio por Incapacidad Laboral: prestación económica que reemplaza la remuneración cuando se cumplen los requisitos correspondientes.

Una persona puede tener una licencia autorizada y, dependiendo de sus antecedentes previsionales o de las reglas aplicables, presentarse situaciones especiales respecto del pago efectivo del subsidio.

En el caso de trabajadores afiliados a Fonasa, ChileAtiende explica que la licencia permite ausentarse del trabajo debido a una incapacidad temporal y puede originar el Subsidio por Incapacidad Laboral cuando se cumplen sus requisitos.

Quién paga las cotizaciones de pensión durante una licencia médica

Durante el período cubierto por el subsidio, la entidad pagadora debe efectuar las cotizaciones previsionales que legalmente correspondan a la persona trabajadora.

En el sistema AFP, esto incluye normalmente la cotización obligatoria para pensiones y la comisión correspondiente a la AFP, considerando las reglas y eventuales excepciones aplicables a cada afiliado.

La existencia de una licencia médica, por lo tanto, no significa que el trabajador tenga que tomar el dinero recibido por concepto de subsidio y pagar personalmente desde su cuenta la cotización obligatoria de AFP. El sistema establece que la entidad pagadora debe enterar las cotizaciones que le corresponden.

Esto también explica por qué el subsidio líquido que recibe una persona no debe compararse directamente con la cotización que aparece posteriormente en su AFP. La base utilizada para cotizar tiene reglas propias.

Quién paga la cotización de salud

La entidad pagadora del subsidio también debe enterar la cotización correspondiente a salud durante el período de incapacidad laboral.

Para quienes pertenecen a Fonasa, la cotización legal de salud corresponde al 7% de la remuneración o renta imponible, respetando el límite imponible vigente.

En el caso de personas afiliadas a una Isapre, la situación puede incluir el 7% legal o un monto superior pactado de acuerdo con el contrato de salud. La normativa de SUSESO contempla que, tratándose de afiliados a Isapre, corresponde enterar el 7% o el monto superior pactado cuando proceda.

Por esta razón, una persona con un plan de Isapre cuyo precio supere el 7% no debería asumir que durante la licencia médica su plan necesariamente quedará financiado solamente hasta ese porcentaje. Debe revisarse el contrato, el valor pactado y la liquidación efectuada por la entidad correspondiente.

Qué pasa con el Seguro de Cesantía

El Seguro de Cesantía tiene una distribución especial durante una licencia médica.

Cuando existe un contrato indefinido, la parte de la cotización de cargo del trabajador —0,6% cuando corresponde— es pagada durante el período de subsidio por la entidad pagadora del Subsidio por Incapacidad Laboral. El empleador, por su parte, continúa siendo responsable de la porción que legalmente le corresponde.

La Superintendencia de Pensiones señala que, para trabajadores con contrato indefinido, el 0,6% correspondiente al trabajador durante la licencia debe ser pagado por la entidad pagadora del subsidio, mientras que el empleador continúa pagando su parte del Seguro de Cesantía. Para contratos a plazo fijo, por obra o faena, la cotización correspondiente continúa siendo de responsabilidad del empleador.

La Administradora de Fondos de Cesantía también mantiene instrucciones específicas para los empleadores respecto de cómo informar los períodos de licencia médica y evitar pagos duplicados o incorrectos.

Nuevas cotizaciones del empleador y cambios vigentes desde agosto de 2026

Este es uno de los aspectos que requiere mayor atención al consultar información reciente, porque la reforma previsional incorporó nuevos aportes de cargo del empleador y estableció una aplicación gradual.

Para las remuneraciones correspondientes a agosto de 2026, el aporte previsional del empleador al nuevo sistema alcanza un total de 3,5% de la remuneración imponible, distribuido de la siguiente forma:

• 0,1% para la cuenta individual del trabajador.
• 0,9% para la Cotización con Rentabilidad Protegida (CRP).
• 2,5% destinado al Seguro Social Previsional, incluyendo SIS y Compensación por Diferencias de Expectativa de Vida.

La información oficial de ChileAtiende establece que para agosto de 2026 la distribución efectiva es 0,1% a la cuenta individual, 0,9% a la Cotización con Rentabilidad Protegida y 2,5% para el componente de Seguro de Invalidez y Sobrevivencia y Compensación por Diferencias de Expectativa de Vida. El porcentaje de CRP aumenta posteriormente a 1,5% desde agosto de 2027.

Esto es relevante porque es posible encontrar información que mencione directamente un 1,5% de CRP como porcentaje definitivo o futuro. Sin embargo, al revisar específicamente las remuneraciones de agosto de 2026 debe aplicarse la gradualidad correspondiente al período.

Quién paga los nuevos aportes cuando existe licencia médica

La reforma previsional también contempla cómo distribuir estos aportes durante los períodos de incapacidad laboral.

La regla oficial establece que la porción destinada a la cuenta individual y la Cotización con Rentabilidad Protegida correspondiente al período cubierto por subsidio es asumida por la entidad pagadora del subsidio, de acuerdo con la gradualidad vigente.

Por su parte, determinados componentes del Seguro Social que permanecen a cargo del empleador continúan siendo responsabilidad de éste durante el período de licencia.

La Subsecretaría de Previsión Social informa expresamente que la Cotización con Rentabilidad Protegida, o el porcentaje que corresponda según la gradualidad, es de cargo de la entidad pagadora del subsidio durante la licencia médica. También mantiene responsabilidades previsionales del empleador durante estos períodos.

Resumen general de quién paga cada cotización

Esta tabla entrega una orientación general para trabajadores dependientes. Las licencias por accidentes laborales, enfermedades profesionales, trabajadores independientes, funcionarios públicos y otras situaciones especiales pueden tener reglas adicionales.

Cómo se calcula la base de las cotizaciones durante la licencia

Uno de los errores más frecuentes consiste en tomar el monto del Subsidio por Incapacidad Laboral y aplicar directamente sobre él todos los porcentajes previsionales.

La normativa establece una lógica diferente.

Para efectos de las cotizaciones correspondientes al período de incapacidad laboral, se utiliza como referencia general la última remuneración o renta imponible correspondiente al mes anterior al inicio de la licencia médica.

Si dicha remuneración no existe, puede ser necesario recurrir a la remuneración estipulada en el contrato de trabajo u otras reglas particulares.

SUSESO ha señalado reiteradamente que las cotizaciones correspondientes al período de incapacidad laboral no se determinan simplemente sobre el monto del SIL pagado, sino sobre la remuneración imponible que corresponda según las reglas previsionales.

Diferencia entre base de cálculo del subsidio y base de las cotizaciones

Esta diferencia merece una explicación especial.

Supongamos que una persona recibe un Subsidio por Incapacidad Laboral calculado utilizando remuneraciones de varios meses anteriores. El valor diario obtenido puede ser inferior al valor diario de su sueldo habitual.

Eso no significa automáticamente que las cotizaciones deban efectuarse sobre el mismo monto líquido que recibió por subsidio.

El cálculo del SIL tiene sus propias normas, que consideran remuneraciones netas y períodos determinados. Las cotizaciones previsionales durante el reposo tienen una regla específica que mira principalmente la última remuneración imponible anterior al inicio de la licencia.

Por eso pueden existir diferencias legítimas entre:

• el sueldo bruto habitual;
• la remuneración imponible;
• el monto diario del subsidio;
• el subsidio líquido recibido;
• la base sobre la cual se enteraron las cotizaciones.

No es correcto comparar solamente el depósito bancario del subsidio con el monto registrado en la AFP y concluir que existe un error.

Qué remuneración se considera

La referencia principal es la remuneración imponible del mes inmediatamente anterior al inicio de la licencia.

Por ejemplo, si la licencia comenzó el 10 de septiembre y en agosto la remuneración imponible fue de $1.000.000, ese monto puede transformarse en la referencia para determinar las cotizaciones correspondientes al reposo, aplicando proporcionalidades, topes y reglas específicas.

Esto puede diferir del sueldo líquido de agosto. El sueldo líquido incorpora descuentos previsionales, impuestos, anticipos y otros conceptos que no necesariamente forman parte de la remuneración imponible.

Qué pasa si el mes anterior también estuvo con licencia

Cuando una persona no registra una remuneración imponible normal en el mes anterior porque estuvo durante todo ese período con licencia médica, puede ser necesario utilizar la remuneración estipulada en el contrato de trabajo o aplicar las reglas correspondientes a licencias continuadas.

La jurisprudencia administrativa de SUSESO ha señalado que, cuando no existe remuneración en el mes anterior, debe revisarse la remuneración contemplada en el contrato, respetando además las normas sobre ingreso mínimo y las características de la remuneración pactada.

Por esta razón, las licencias largas o sucesivas pueden generar liquidaciones más complejas que una licencia aislada de algunos días.

Qué ocurre con las licencias continuadas

Cuando existen licencias médicas sucesivas sin interrupción, la entidad pagadora debe determinar si se trata de una continuación del mismo período de incapacidad o de una nueva situación que exige revisar nuevamente determinadas bases.

No debe suponerse que cada formulario de licencia reinicia automáticamente todos los cálculos.

El diagnóstico, la continuidad temporal y la normativa aplicable pueden influir en la determinación administrativa.

Si existen varias licencias consecutivas y las cotizaciones cambian abruptamente de un mes a otro sin una explicación aparente, conviene solicitar el detalle del cálculo a la entidad pagadora.

Qué pasa cuando la licencia cubre todo el mes

Si una persona permanece con licencia médica durante todo un mes, normalmente no tendrá remuneración por días efectivamente trabajados durante dicho período en el sector privado, sino que recibirá el subsidio que corresponda si cumple los requisitos.

En este escenario, la entidad pagadora asume las cotizaciones asociadas al período subsidiado que legalmente le corresponden, mientras el empleador continúa pagando aquellas cotizaciones que siguen siendo de su responsabilidad.

ChileAtiende explica que cuando un trabajador permanece con licencia todo el mes, la entidad pagadora del SIL paga las cotizaciones de cargo del trabajador —incluyendo pensión, salud y, cuando corresponde, el 0,6% del Seguro de Cesantía— además de determinados componentes del nuevo aporte previsional. El empleador conserva otras obligaciones previsionales.

Qué ocurre cuando la licencia cubre solo algunos días del mes

Cuando una persona trabaja parte del mes y permanece con licencia el resto, el registro previsional puede dividirse entre ambos períodos.

Por los días trabajados existe una remuneración pagada por el empleador y las cotizaciones correspondientes a dicha remuneración.

Por los días de incapacidad, la entidad pagadora del subsidio debe enterar las cotizaciones que sean de su responsabilidad.

Esto puede provocar que una misma cartola mensual muestre pagos de distinta procedencia.

Además, algunos aportes de cargo exclusivo del empleador mantienen reglas específicas durante todo el período, por lo que la liquidación completa no siempre puede reconstruirse correctamente multiplicando el sueldo por el número de días trabajados.

Ejemplo simple de una licencia durante todo el mes

Considere una persona con contrato indefinido cuya última remuneración imponible anterior al comienzo de la licencia fue de $1.200.000.

Si permanece durante todo el período correspondiente con licencia y se cumplen las condiciones para el pago del subsidio, una explicación simplificada de algunas cotizaciones sería:

El ejemplo tiene fines explicativos. No incorpora todas las cotizaciones posibles ni reemplaza una liquidación previsional, porque pueden intervenir topes imponibles, plan de Isapre, tasa AFP, tipo de contrato, exenciones, origen de la licencia y otros componentes de cargo del empleador.

Ejemplo de una licencia parcial

Suponga ahora que la misma persona trabaja una parte del mes y tiene licencia durante los días restantes.

En ese caso existirán dos componentes:

• las cotizaciones correspondientes a la remuneración pagada por los días trabajados;
• las cotizaciones vinculadas al período de incapacidad laboral.

El empleador debe informar correctamente el movimiento de personal y los días de licencia, mientras que la entidad pagadora debe enterar las cotizaciones correspondientes al subsidio.

No es recomendable calcular una licencia parcial simplemente dividiendo el sueldo por 30 y aplicando todos los porcentajes al resultado, porque algunas cotizaciones tienen reglas particulares respecto de quién las paga y sobre qué base deben determinarse.

Las cotizaciones pueden existir incluso en los primeros días sin pago de subsidio

En las licencias de origen común existe una regla conocida como período de carencia. Cuando una licencia tiene una duración inferior a once días, el subsidio normalmente comienza a pagarse desde el cuarto día. Cuando el reposo supera ese umbral, se aplican las reglas correspondientes para el pago desde el inicio.

Sin embargo, esto no significa que los tres primeros días de una licencia corta queden necesariamente sin cotizaciones.

SUSESO ha señalado que las cotizaciones deben cubrir el período de incapacidad laboral desde el primer día, incluso cuando los primeros días no generan pago efectivo de subsidio por aplicación de la carencia.

Esta diferencia es muy importante:

• una cosa es desde qué día se paga dinero por concepto de SIL;
• otra cosa es el período que debe quedar cubierto previsionalmente.

Qué ocurre con la cotización para trabajos pesados

La cotización adicional asociada a trabajos pesados tiene un tratamiento diferente durante los períodos de licencia médica.

La normativa previsional establece que no corresponde enterar las cotizaciones por trabajos pesados contempladas en el artículo 17 bis del Decreto Ley N° 3.500 durante el período en que el trabajador se encuentra con reposo médico.

Por ello, una persona que normalmente registra esa cotización podría observar que no aparece durante los días cubiertos por licencia médica sin que ello signifique necesariamente un error.

Licencia médica por enfermedad común y licencia de origen laboral

También debe distinguirse el origen de la incapacidad.

Una licencia por enfermedad o accidente común funciona bajo el régimen general de salud correspondiente a Fonasa o Isapre.

Una incapacidad causada por accidente del trabajo, accidente de trayecto o enfermedad profesional queda vinculada al Seguro Social de la Ley N° 16.744 y puede involucrar a una mutualidad o al Instituto de Seguridad Laboral.

En ambos casos existen cotizaciones durante la incapacidad, pero la institución responsable del subsidio y algunas obligaciones pueden cambiar.

Por eso, antes de reclamar una cotización faltante, conviene confirmar si la licencia fue calificada como común o laboral.

Cotizaciones en accidentes del trabajo y enfermedades profesionales

Cuando la incapacidad tiene origen laboral, el organismo administrador correspondiente debe otorgar las prestaciones económicas y enterar las cotizaciones previsionales que correspondan durante el período de subsidio.

SUSESO señala para estos casos que las cotizaciones de pensión y salud se determinan utilizando como referencia la última remuneración o renta imponible del mes anterior al inicio del reposo, o la remuneración contractual cuando corresponda.

La distribución de determinadas cotizaciones del empleador puede diferir respecto de una licencia de origen común, especialmente en aquellas relacionadas directamente con el seguro de accidentes laborales.

Si existe discusión sobre si una enfermedad es común o profesional, es recomendable esperar o solicitar la resolución de calificación correspondiente antes de interpretar la cartola previsional.

Trabajadores del sector público

El tratamiento económico de las licencias médicas de funcionarios públicos puede diferir considerablemente del régimen habitual del trabajador privado.

En diversos regímenes estatutarios, el funcionario mantiene sus remuneraciones durante la licencia médica y posteriormente el organismo empleador solicita el reembolso correspondiente a la entidad pagadora.

SUSESO explica que funcionarios de municipalidades, corporaciones municipales y determinados servicios públicos mantienen la totalidad de sus remuneraciones durante los períodos de licencia, mientras el empleador gestiona posteriormente los reembolsos que correspondan.

Por esta razón, no conviene aplicar automáticamente a un funcionario público el mismo análisis utilizado para un trabajador dependiente del sector privado.

Trabajadores independientes

Los trabajadores independientes también pueden acceder a cobertura por incapacidad laboral cuando cumplen los requisitos correspondientes, pero su base de cotización puede estar relacionada con el régimen mediante el cual enteran sus cotizaciones, incluida la Operación Renta.

Para independientes obligados a cotizar existen reglas especiales que utilizan como referencia la renta imponible anual considerada para determinar sus cotizaciones, según el beneficio y régimen de que se trate.

La modalidad de cobertura completa o parcial también puede influir en la protección efectiva disponible. La Subsecretaría de Previsión Social señala que en 2026 el régimen transitorio de cobertura parcial considera un porcentaje determinado de la renta imponible y que esta decisión impacta beneficios de seguridad social como las licencias médicas.

Por ello, un trabajador independiente no debería utilizar como referencia el procedimiento de un trabajador con contrato indefinido sin revisar primero su propia situación previsional.

Aspectos importantes que debe conocer el usuario

El monto líquido recibido no determina las cotizaciones

El monto depositado en la cuenta bancaria por concepto de licencia médica corresponde al subsidio líquido después de aplicar las reglas correspondientes.

Las cotizaciones pueden calcularse sobre una base previsional diferente. Por ello, recibir $500.000 de subsidio no significa que las cotizaciones deban aparecer obligatoriamente calculadas sobre $500.000.

La remuneración imponible no es el sueldo líquido

Cuando una institución habla de la última remuneración imponible, debe revisarse la liquidación de sueldo y localizar específicamente ese valor.

No debe utilizarse el total líquido a pagar, porque ese monto ya incorpora descuentos y puede incluir conceptos que no tienen el mismo tratamiento previsional.

Existen topes imponibles

Las cotizaciones previsionales están sujetas a límites imponibles que se actualizan periódicamente.

Por ello, una persona con una remuneración muy alta puede observar que sus cotizaciones no se calcularon sobre la totalidad de su sueldo.

En materia de salud, la Superintendencia de Salud informa que desde las remuneraciones devengadas en febrero de 2026 el límite imponible mensual utilizado para la cotización legal de salud corresponde a 90 UF.

La comisión de AFP no es igual para todos

El 10% obligatorio destinado a la cuenta de capitalización individual no debe confundirse con la comisión cobrada por la administradora.

Como las AFP pueden cobrar distintas comisiones, dos trabajadores con exactamente la misma renta imponible pueden presentar diferencias en el total enterado al sistema previsional.

El plan de Isapre puede modificar la cotización efectiva de salud

En Fonasa la referencia general es la cotización legal del 7%.

En Isapre puede existir un precio de plan superior. La Superintendencia de Salud explica que los afiliados deben destinar al menos la cotización legal y, cuando el plan contratado tiene un precio superior, puede existir un costo adicional asociado al contrato.

Las tasas del empleador cambian según el año

La reforma previsional estableció un calendario de aumento gradual de las cotizaciones del empleador.

Por esta razón, un cálculo correspondiente a 2025 no debe copiarse automáticamente para 2026, 2027 o años posteriores.

Por ejemplo, la Cotización con Rentabilidad Protegida comienza con una tasa de 0,9% para las remuneraciones de agosto de 2026 y pasa a 1,5% desde las remuneraciones de agosto de 2027.

No todos los contratos pagan el mismo Seguro de Cesantía

La distribución del Seguro de Cesantía depende de si el contrato es indefinido, a plazo fijo, por obra o faena y de otras condiciones legales.

Por eso debe revisarse primero el tipo de contrato antes de determinar quién debía pagar cada porcentaje durante la licencia.

Una cotización que aparece después no necesariamente está atrasada

La fecha en que aparece una cotización en una cartola puede depender del momento en que la licencia fue autorizada, procesada y pagada.

Las entidades pagadoras tienen plazos para enterar las cotizaciones una vez que corresponde efectuar el pago. La normativa contempla, en términos generales, plazos durante el mes siguiente, con reglas específicas para pagos electrónicos.

Por ello, una cotización que todavía no aparece mientras la licencia continúa en trámite no debe calificarse inmediatamente como deuda previsional.

Cómo realizar el proceso o encontrar la información

Si desea comprobar que sus cotizaciones fueron pagadas correctamente durante una licencia médica, lo recomendable es revisar la información de manera ordenada.

Reunir las licencias médicas

Anote para cada licencia:

• fecha de inicio;
• fecha de término;
• cantidad de días;
• tipo de licencia;
• estado de autorización;
• entidad pagadora;
• si existe continuidad con una licencia anterior.

Revisar la última liquidación anterior a la licencia

Busque la remuneración imponible correspondiente al mes anterior al inicio del reposo.

No utilice únicamente el sueldo líquido.

También conviene identificar:

• renta imponible AFP;
• renta imponible de salud;
• renta imponible del Seguro de Cesantía;
• AFP y comisión aplicable;
• Fonasa o Isapre;
• tipo de contrato;
• cotizaciones adicionales habituales.

Solicitar la liquidación del subsidio

La entidad pagadora debe poder entregar antecedentes sobre el Subsidio por Incapacidad Laboral pagado.

Revise especialmente:

• número de licencia;
• período reconocido;
• días pagados;
• valor diario del subsidio;
• base utilizada;
• cotizaciones enteradas;
• instituciones receptoras.

Descargar la cartola de AFP

Compare el período de licencia con los movimientos que aparecen en la administradora.

Si el mes tuvo días trabajados y días de licencia, podrían existir registros provenientes de distintos pagadores.

Revisar las cotizaciones de salud

Si pertenece a Fonasa, consulte sus cotizaciones en los canales habilitados por la institución.

Si pertenece a Isapre, revise el estado de cotizaciones y el valor efectivamente imputado al plan.

Consultar el Seguro de Cesantía

Las cotizaciones correspondientes al Seguro de Cesantía pueden revisarse en la Administradora de Fondos de Cesantía.

Si aparece una diferencia, confirme primero si su contrato era indefinido, a plazo, por obra o faena durante el período cuestionado.

Comparar los datos antes de presentar un reclamo

Prepare una tabla sencilla:

Este ejercicio facilita detectar si realmente existe una cotización faltante o si simplemente fue pagada por una entidad distinta del empleador.

Recomendaciones antes de comenzar

• No compare el subsidio líquido con la renta imponible sin revisar cómo se calculó cada uno.
• Use siempre la fecha exacta de inicio de la primera licencia del período.
• Confirme si existen licencias continuadas.
• Identifique si la enfermedad o accidente fue común o laboral.
• Revise el tipo de contrato vigente durante la licencia.
• Compruebe si estaba afiliado a Fonasa o Isapre.
• Revise los porcentajes vigentes en el mes correspondiente.
• Guarde liquidaciones de sueldo, certificados de cotizaciones y comprobantes del SIL.
• No use porcentajes encontrados en documentos antiguos sin verificar la gradualidad previsional.

Errores comunes que conviene evitar

Pensar que el empleador debe pagar todas las cotizaciones. Durante la licencia existen cotizaciones que legalmente corresponden a la entidad pagadora del subsidio.

Pensar que la entidad pagadora debe asumir todas las cotizaciones. Determinados aportes continúan siendo de responsabilidad del empleador.

Calcular todo sobre el subsidio líquido. La base de las cotizaciones tiene reglas propias.

Usar el sueldo líquido como renta imponible. Son montos diferentes.

Ignorar el período de gradualidad de la reforma previsional. Las tasas de 2026 no son necesariamente las mismas de años siguientes.

Interpretar una licencia corta como tres días sin previsión. Aunque exista carencia para el pago de SIL, las cotizaciones correspondientes al período de incapacidad tienen una regulación diferente.

No distinguir enfermedad común de accidente laboral. El organismo responsable puede cambiar completamente.

Reclamar antes de que la licencia sea resuelta. Una licencia pendiente todavía puede no haber generado el proceso definitivo de pago y registro.

Confundir la cotización obligatoria de AFP con la comisión. Ambas forman parte de la operación previsional, pero corresponden a conceptos distintos.

Cómo revisar si las cotizaciones fueron pagadas correctamente

Revisión de la AFP

Ingrese al sitio de su AFP y descargue un certificado o cartola de cotizaciones que cubra al menos los meses anteriores, el período de la licencia y los meses posteriores.

Revise:

• renta imponible informada;
• monto de cotización;
• fecha de pago;
• identificación del pagador;
• existencia de meses declarados pero no pagados;
• eventuales movimientos posteriores o correcciones.

Es útil descargar un período más amplio porque determinadas regularizaciones pueden aparecer con posterioridad.

Revisión en salud

En Fonasa puede consultar antecedentes previsionales y verificar los pagos asociados a su afiliación.

En Isapre conviene solicitar una cartola detallada, especialmente si el plan tiene un valor superior a la cotización legal.

Si detecta que se enteró solamente el 7% y su contrato contempla un valor superior que debía ser cubierto durante el subsidio, consulte directamente a la Isapre y a la entidad pagadora para determinar si existe una diferencia pendiente.

Revisión del Seguro de Cesantía

Ingrese a su cuenta de AFC y consulte las cotizaciones del período.

Recuerde que en un contrato indefinido puede existir una distribución entre la parte correspondiente al trabajador durante el subsidio y la parte de cargo del empleador.

Por ello, el análisis debe realizarse sobre el conjunto de los pagos y no únicamente buscando una sola transacción.

Certificado de subsidios

En licencias de origen laboral pagadas por el Instituto de Seguridad Laboral puede solicitarse un certificado de subsidios que muestra, entre otros antecedentes, el monto diario pagado y las cotizaciones previsionales asociadas.

ChileAtiende señala que este certificado permite revisar los montos correspondientes a previsión, salud y Seguro de Cesantía pagados durante el período.

Qué hacer si falta una cotización

Determinar primero quién debía pagarla

Antes de reclamar al empleador, confirme si la cotización faltante correspondía efectivamente a éste.

Si se trata de la cotización de pensión correspondiente a los días subsidiados, por ejemplo, puede ser responsabilidad de la institución que pagó la licencia.

En cambio, determinados aportes de cargo patronal continúan siendo responsabilidad del empleador.

Solicitar una explicación a la entidad pagadora

Si falta una cotización correspondiente al período subsidiado, pida:

• detalle del cálculo;
• base imponible utilizada;
• fecha de pago;
• institución previsional receptora;
• número de planilla o comprobante;
• período informado.

Con estos antecedentes es más fácil determinar si existe realmente una deuda o solamente un desfase en la actualización de la cartola.

Consultar al empleador cuando corresponda

Si la diferencia corresponde a remuneraciones de días trabajados o a cotizaciones que continúan siendo de responsabilidad empresarial, solicite al empleador el comprobante de declaración y pago.

En muchos casos puede existir un error de información, una rectificación pendiente o una cotización declarada pero todavía no enterada.

Presentar un reclamo ante el organismo fiscalizador

Si la institución responsable no corrige una diferencia debidamente acreditada, puede recurrirse al organismo competente según el tipo de cotización.

La SUSESO fiscaliza materias asociadas a licencias médicas y Subsidios por Incapacidad Laboral; la Superintendencia de Pensiones supervisa materias del sistema previsional y AFP; la Superintendencia de Salud interviene en materias relacionadas con Fonasa e Isapres, dentro de sus respectivas competencias.

Situaciones especiales que pueden modificar el análisis

Licencia rechazada

Cuando una licencia es rechazada, el tratamiento puede cambiar porque deja de existir un período de incapacidad autorizado en los mismos términos.

Si posteriormente el rechazo es revertido mediante reposición o reclamación, la entidad correspondiente deberá efectuar las regularizaciones que procedan.

Por eso, mientras un recurso se encuentra pendiente, es posible que las cartolas todavía no reflejen el resultado definitivo.

Licencia reducida

Si una licencia originalmente otorgada por 30 días es finalmente autorizada solamente por 15, los otros 15 días dejan de estar cubiertos por esa autorización.

La remuneración, ausencias y cotizaciones asociadas a esos días deberán analizarse conforme a lo que finalmente haya sido resuelto y a la situación laboral efectiva.

Licencia ampliada

Una ampliación puede modificar el período definitivo de incapacidad reconocido y dar lugar a ajustes adicionales de subsidio y cotizaciones.

Licencia emitida por pocos días

Una licencia corta puede estar afecta al período de carencia para el pago del subsidio de origen común. Sin embargo, como se explicó anteriormente, esto no significa necesariamente ausencia de cotizaciones durante esos primeros días.

Licencias seguidas durante varios meses

Cuando el reposo se extiende durante meses, es especialmente importante revisar si las licencias son continuadas y qué base previsional está utilizando la entidad.

No es inusual que una persona suponga que debe utilizarse como referencia el último mes de licencia cuando la normativa puede exigir mantener otra base.

Cambio de empleador

Si la persona cambió de empleador poco antes del inicio de una licencia médica, la entidad pagadora puede necesitar antecedentes adicionales para determinar correctamente remuneraciones, afiliación y cotizaciones.

Conviene conservar contratos, finiquitos, certificados de cotizaciones y liquidaciones de ambos empleadores.

Más de un empleador

Una persona puede tener dos relaciones laborales simultáneas y presentar una incapacidad que afecta ambas.

En ese escenario, el análisis de remuneraciones, licencias y subsidios debe realizarse considerando cada vínculo laboral y los topes imponibles correspondientes.

La existencia de dos empleadores no autoriza a duplicar ilimitadamente la base imponible por sobre los límites legales.

Bonos y remuneraciones variables

Comisiones, bonos, gratificaciones y otros conceptos pueden tener tratamientos distintos para efectos de cálculo del SIL y para determinar remuneraciones imponibles.

Esta es otra razón por la cual no debe reconstruirse una licencia únicamente mirando el sueldo base del contrato.

Si la remuneración es principalmente variable, conviene solicitar a la entidad pagadora el detalle de los datos utilizados.

Cambio de AFP

Si el trabajador cambió de AFP cerca de la fecha de la licencia, puede ocurrir que algunos movimientos aparezcan en una administradora y otros en la nueva.

Antes de denunciar una cotización faltante, revise las cartolas de ambas instituciones y la fecha exacta en que se hizo efectivo el cambio.

Cambio entre Fonasa e Isapre

Cuando existe un cambio de sistema de salud durante un período cercano a una licencia, es importante revisar la fecha de vigencia efectiva de la afiliación.

No debe determinarse el destinatario de la cotización solamente por la institución a la que pertenece actualmente el trabajador.

Canales, alternativas o recursos útiles

Superintendencia de Seguridad Social

La Superintendencia de Seguridad Social (SUSESO) dispone de información normativa sobre licencias médicas, Subsidio por Incapacidad Laboral, cotizaciones durante los períodos de reposo y mecanismos de reclamación.

Es uno de los principales recursos cuando la controversia se relaciona con la autorización de una licencia, el SIL o la actuación de la entidad pagadora.

ChileAtiende

En ChileAtiende se puede encontrar información sobre licencias médicas, reforma previsional, aportes del empleador y numerosos trámites vinculados a seguridad social.

También es útil para identificar qué institución debe resolver un determinado problema.

Superintendencia de Pensiones

La Superintendencia de Pensiones publica información oficial sobre AFP, cotizaciones previsionales, Seguro Social Previsional y la gradualidad de los nuevos aportes del empleador.

Es especialmente recomendable consultar este sitio cuando se desea verificar los porcentajes vigentes en un año determinado.

Superintendencia de Salud

La Superintendencia de Salud dispone de orientación sobre cotizaciones de Fonasa e Isapres, planes de salud, excedentes, excesos y derechos de los afiliados.

Fonasa

En Fonasa puede revisarse información relacionada con afiliación, cotizaciones y beneficios del sistema público de salud.

Administradora de Fondos de Cesantía

En AFC Chile se pueden revisar las cotizaciones del Seguro de Cesantía y las instrucciones relacionadas con licencias médicas.

Previred

Previred es ampliamente utilizado por empleadores y entidades para declarar y pagar cotizaciones previsionales.

Si existe una diferencia, el empleador puede revisar los comprobantes y movimientos asociados al período correspondiente.

Instituto de Seguridad Laboral

Cuando la licencia se encuentra relacionada con un accidente del trabajo o una enfermedad profesional y la cobertura corresponde al sistema público, puede consultarse al Instituto de Seguridad Laboral.

Cuándo conviene usar cada alternativa

SUSESO: cuando el problema está relacionado principalmente con el subsidio, el cálculo, la licencia médica o la entidad pagadora.

AFP o Superintendencia de Pensiones: cuando existe una diferencia en pensión, cuenta individual o nuevos aportes previsionales.

Fonasa, Isapre o Superintendencia de Salud: cuando la diferencia corresponde a cotizaciones de salud.

AFC: cuando falta o parece incorrecta una cotización del Seguro de Cesantía.

Mutualidad o ISL: cuando la incapacidad deriva de un accidente del trabajo, accidente de trayecto o enfermedad profesional.

Empleador: cuando la diferencia corresponde a días efectivamente trabajados o a cotizaciones que permanecen de responsabilidad empresarial.

Cómo interpretar una cartola previsional durante una licencia médica

Revisar el período y no solamente el mes de pago

Una cotización puede ser pagada en un mes posterior al período al cual corresponde.

Por ejemplo, una cotización enterada en octubre puede corresponder previsionalmente a septiembre.

Lo importante es identificar el período de remuneración informado.

Identificar al pagador

Si aparece una Caja de Compensación, Isapre, mutualidad u otra entidad en lugar de su empresa, esto puede ser completamente normal cuando corresponde al período de licencia médica.

Comparar la renta imponible correcta

No compare automáticamente el monto informado en la cartola con el dinero recibido durante ese mes.

Revise cuál era la renta imponible que correspondía utilizar según las reglas del período de incapacidad.

Verificar días trabajados y días de licencia

Una diferencia puede explicarse simplemente porque parte del mes fue pagado como remuneración y el resto como subsidio.

En estos casos es importante sumar y analizar todos los movimientos asociados al mismo período.

Buscar rectificaciones posteriores

Las instituciones pueden realizar ajustes cuando una licencia es modificada, autorizada tardíamente o sometida a reclamación.

Por eso conviene descargar nuevamente las cartolas después de que el proceso haya terminado definitivamente.

Preguntas frecuentes

¿Se dejan de pagar las cotizaciones cuando estoy con licencia médica?

No como regla general. Los períodos de incapacidad laboral tienen continuidad previsional y existen cotizaciones que deben ser pagadas por la entidad pagadora del subsidio y otras que permanecen bajo responsabilidad del empleador.

¿Quién paga mi AFP cuando estoy con licencia médica?

Durante el período subsidiado, la entidad pagadora del Subsidio por Incapacidad Laboral debe enterar las cotizaciones previsionales que correspondan al trabajador, incluyendo la cotización obligatoria para pensión y la comisión correspondiente, conforme a las reglas aplicables.

¿El empleador deja de pagar todo mientras estoy con licencia?

No. Aunque determinadas cotizaciones pasan a ser enteradas por la entidad pagadora del subsidio, el empleador conserva obligaciones previsionales propias durante el período de licencia.

¿Quién paga el 7% de salud durante la licencia?

La entidad pagadora del subsidio debe enterar la cotización de salud correspondiente durante el período de incapacidad.

Si pertenece a Isapre y tiene un plan superior al 7%, debe revisarse además el valor pactado y las reglas del contrato de salud.

¿Pierdo cobertura de Fonasa por estar con licencia?

La licencia médica no implica por sí sola dejar de pertenecer a Fonasa. Las cotizaciones correspondientes al período de incapacidad deben ser enteradas según las reglas aplicables.

¿Mi Isapre puede quedar impaga durante la licencia?

La entidad pagadora debe enterar las cotizaciones que correspondan. Si observa una deuda o diferencia, revise la liquidación del SIL, la cartola de Isapre y el valor de su plan.

¿Las cotizaciones se calculan sobre el dinero que recibo por licencia?

No necesariamente. La base de las cotizaciones previsionales tiene reglas propias y generalmente utiliza como referencia la última remuneración imponible del mes anterior al inicio de la licencia.

¿Qué pasa si mi subsidio es mucho menor que mi sueldo?

Eso no significa automáticamente que las cotizaciones deban calcularse sobre el mismo monto reducido. El SIL y las cotizaciones tienen procedimientos de cálculo diferentes.

¿Qué pasa si la licencia comienza a mitad de mes?

El mes puede contener una parte de remuneración por días trabajados y otra asociada al subsidio. En consecuencia, puede haber cotizaciones enteradas tanto por el empleador como por la entidad pagadora.

¿Quién paga el Seguro de Cesantía durante una licencia médica?

En contratos indefinidos, la cotización de cargo del trabajador correspondiente al 0,6%, cuando procede, es enterada por la entidad pagadora durante el subsidio. El empleador continúa pagando la parte que legalmente le corresponde.

¿Qué pasa con el Seguro de Cesantía si tengo contrato a plazo fijo?

La distribución es diferente a la de un contrato indefinido. La cotización correspondiente al empleador continúa siendo responsabilidad de éste conforme a las reglas del Seguro de Cesantía.

¿Los primeros tres días de una licencia corta quedan sin cotizaciones?

No necesariamente. Aunque exista carencia para el pago del Subsidio por Incapacidad Laboral en determinadas licencias de origen común de menos de once días, SUSESO ha señalado que las cotizaciones previsionales deben cubrir el período de incapacidad desde el primer día.

¿Quién paga las nuevas cotizaciones de la reforma previsional durante una licencia?

Existe una distribución entre la entidad pagadora del subsidio y el empleador. La parte destinada a cuenta individual y la Cotización con Rentabilidad Protegida correspondiente al período subsidiado es asumida por la entidad pagadora, mientras otros componentes continúan siendo responsabilidad del empleador.

¿Cuánto es la Cotización con Rentabilidad Protegida en agosto de 2026?

Para las remuneraciones correspondientes a agosto de 2026 la tasa aplicable de CRP es 0,9% de la remuneración imponible. El porcentaje aumenta a 1,5% desde agosto de 2027 conforme a la gradualidad establecida.

¿Por qué algunas páginas mencionan 1,5%?

Porque 1,5% es el porcentaje que alcanza posteriormente la Cotización con Rentabilidad Protegida. Durante el primer período de implementación, desde las remuneraciones de agosto de 2026, la tasa efectiva es 0,9%.

¿Qué pasa con el aporte del empleador a mi cuenta individual?

Para las remuneraciones de agosto de 2026 el aporte de cargo del empleador destinado directamente a la cuenta individual corresponde al 0,1%, conforme a la gradualidad vigente.

¿La reforma previsional me descuenta más dinero del subsidio?

Los nuevos aportes establecidos como cotizaciones de cargo del empleador no deben interpretarse como un descuento adicional directo al sueldo o subsidio del trabajador. Su financiamiento corresponde al empleador o a la entidad pagadora del subsidio según la distribución legal.

¿Qué pasa si mi empleador no pagó su parte?

Debe solicitar el comprobante de declaración y pago y verificar qué cotización estaba legalmente obligado a enterar. Si existe una deuda efectiva y no es regularizada, pueden utilizarse los mecanismos de cobranza y fiscalización correspondientes.

¿Qué pasa si la entidad pagadora no pagó mi AFP?

Solicite primero un certificado o detalle del subsidio y el comprobante de las cotizaciones enteradas. Si se confirma la omisión, reclame ante la institución responsable y, si no existe solución, puede recurrir al organismo fiscalizador competente.

¿Puedo revisar quién pagó mis cotizaciones?

Sí. Las cartolas previsionales generalmente permiten identificar al pagador, período, renta imponible y monto enterado. También puede solicitar certificados a AFP, AFC, instituciones de salud y entidades pagadoras.

¿Por qué aparece una Caja de Compensación en mi AFP?

Puede ocurrir porque la Caja actuó como entidad pagadora del Subsidio por Incapacidad Laboral y enteró las cotizaciones correspondientes al período de licencia.

¿Qué pasa si mi licencia está pendiente?

Mientras la licencia no haya sido resuelta definitivamente, algunos pagos y cotizaciones pueden encontrarse pendientes de procesamiento. Conviene revisar nuevamente las cartolas después de la autorización y pago.

¿Qué ocurre si mi licencia es rechazada?

Un rechazo puede modificar el derecho al subsidio y el tratamiento previsional del período. Si se presenta una reclamación y posteriormente la licencia es autorizada, deben realizarse las regularizaciones correspondientes.

¿Qué ocurre si mi licencia es reducida?

La entidad pagadora debe recalcular el período reconocido. Los días no autorizados deben analizarse según la relación laboral y el resultado definitivo del procedimiento.

¿Una licencia médica genera una laguna previsional?

Una licencia correctamente tramitada y cubierta previsionalmente no debería producir automáticamente una laguna por el solo hecho de existir reposo. Precisamente las reglas de cotización durante incapacidad buscan mantener la continuidad de la protección previsional.

¿Las cotizaciones cuentan para mi futura pensión?

Las cotizaciones correctamente enteradas durante el período de licencia se incorporan al registro previsional de acuerdo con su naturaleza, al igual que las demás cotizaciones legalmente reconocidas.

¿La Cotización con Rentabilidad Protegida aparece en mi cuenta AFP normal?

La CRP tiene un tratamiento diferente al ahorro tradicional depositado directamente en la cuenta individual. Forma parte del nuevo Seguro Social Previsional y se registra conforme a las reglas del Fondo Autónomo de Protección Previsional y del Bono de Seguridad Previsional.

¿Cómo sé si calcularon bien mi renta imponible?

Compare la base informada por la entidad pagadora con la remuneración imponible del mes anterior al inicio de la licencia, revise si existía otra licencia durante ese período y compruebe si se aplicaron correctamente los topes legales.

¿Qué pasa si el mes anterior no trabajé porque también estaba con licencia?

La entidad debe revisar las reglas aplicables a licencias continuadas y, cuando no exista remuneración imponible utilizable, puede ser necesario recurrir a la remuneración estipulada en el contrato u otra base definida legalmente.

¿Las comisiones y bonos forman parte del cálculo?

Depende del concepto, su carácter imponible y de si se está calculando el SIL o la base de las cotizaciones. No todos los bonos reciben el mismo tratamiento.

¿Qué pasa si mi sueldo subió justo antes de la licencia?

Si el aumento ya se reflejaba correctamente en la remuneración imponible que debe utilizarse como referencia, puede influir en las cotizaciones. Si el aumento comenzó durante el período de reposo, la situación requiere revisar la regla aplicable y los antecedentes contractuales.

¿Puedo pagar yo mismo una cotización que falta?

No es recomendable intentar corregir directamente una omisión que corresponde al empleador o a la entidad pagadora sin antes determinar la causa. Un pago voluntario podría no solucionar el período mal informado y puede generar duplicidades.

¿Qué hago si aparecen dos pagos por el mismo mes?

Primero compruebe si uno corresponde a días trabajados y otro a días de licencia. Si ambos cubren exactamente la misma base y período de manera duplicada, consulte a las entidades involucradas antes de solicitar cualquier devolución.

¿Puedo tener cotizaciones pagadas por el empleador y por la entidad de licencia en un mismo mes?

Sí. Es habitual cuando el trabajador presta servicios durante una parte del mes y permanece con licencia durante otra.

¿Las cotizaciones por licencia tienen un plazo para aparecer?

Existen plazos legales para declarar y enterar cotizaciones, pero la fecha efectiva en que se reflejan en una cartola puede depender de la autorización y procesamiento de la licencia. Una licencia recién aprobada puede requerir algunos movimientos administrativos antes de que toda la información quede consolidada.

¿Dónde reclamo si el problema es el cálculo del subsidio?

Primero debe solicitar revisión a la entidad que efectuó el cálculo. Dependiendo del régimen y del problema, puede existir la posibilidad de reclamar ante COMPIN, SUSESO u otra institución competente.

¿Dónde reclamo si el problema es con una Isapre?

Puede solicitar primero una revisión formal a la propia Isapre. Si la controversia no se resuelve y corresponde a una materia de su competencia, puede recurrir a la Superintendencia de Salud.

¿Dónde reclamo si falta una cotización de AFP?

Primero determine quién era el obligado a pagarla. Posteriormente puede solicitar regularización al empleador o entidad pagadora y, si corresponde, consultar a la AFP o a la Superintendencia de Pensiones.

¿Dónde reclamo si el problema es el Seguro de Cesantía?

Puede revisar y consultar directamente a AFC Chile, presentando los antecedentes del contrato, licencia médica y cotizaciones observadas.

Documentos que conviene conservar

Una revisión previsional es mucho más sencilla cuando se mantienen respaldos completos.

• Contrato de trabajo y anexos.
• Liquidaciones de sueldo de los meses anteriores a la licencia.
• Licencias médicas y comprobantes electrónicos.
• Resoluciones de autorización, rechazo, reducción o ampliación.
• Liquidaciones del Subsidio por Incapacidad Laboral.
• Certificados de cotizaciones AFP.
• Cartolas de salud.
• Cartola del Seguro de Cesantía.
• Comprobantes entregados por el empleador.
• Certificados de la entidad pagadora.
• Resoluciones de COMPIN, Isapre, mutualidad, ISL o SUSESO cuando existan reclamaciones.

No es recomendable eliminar estos antecedentes apenas termina una licencia prolongada, ya que pueden ser necesarios meses después para aclarar diferencias previsionales o solicitar una reliquidación.

Cómo hacer un cálculo orientativo sin confundirse

Identificar la remuneración imponible de referencia

Localice la remuneración imponible del mes inmediatamente anterior al comienzo de la licencia.

Ejemplo:

Remuneración imponible anterior: $900.000.

Identificar la duración del reposo

Anote la cantidad exacta de días autorizados y determine si la licencia cubrió todo el mes o solamente parte de él.

Separar cotizaciones del trabajador y cotizaciones del empleador

Entre las de cargo del trabajador pueden encontrarse pensión, comisión AFP, salud y, en contratos indefinidos, el porcentaje correspondiente del Seguro de Cesantía.

Las nuevas cotizaciones del empleador deben analizarse separadamente según la gradualidad.

Aplicar solamente tasas vigentes para el período consultado

Para agosto de 2026 no debe utilizarse automáticamente el porcentaje previsto para agosto de 2027.

En particular:

• cuenta individual adicional del empleador: 0,1%;
• Cotización con Rentabilidad Protegida: 0,9%;
• componente SIS y Compensación por Diferencias de Expectativa de Vida dentro del Seguro Social: 2,5%.

Considerar el tipo de contrato

Este dato es indispensable para el Seguro de Cesantía.

Confirmar la institución de salud

Fonasa y una Isapre con un plan superior al 7% pueden generar montos distintos.

Comparar el resultado con certificados oficiales

Un cálculo manual sirve para detectar diferencias importantes, pero no reemplaza la liquidación oficial porque puede haber topes, proporcionalidades, cambios contractuales y reglas especiales que no resultan visibles únicamente con el sueldo.

Por qué es importante mantener las cotizaciones durante una licencia

Las cotizaciones previsionales no son únicamente descuentos mensuales. Se relacionan con distintos componentes de la protección social de una persona.

Mantener correctamente registrados los períodos de incapacidad contribuye a evitar lagunas injustificadas en la trayectoria previsional.

Las cotizaciones pueden influir, según cada régimen, en:

• ahorro previsional para la futura pensión;
• mantención de la cobertura de salud;
• registro del Seguro de Cesantía;
• acceso a determinadas prestaciones previsionales;
• acreditación de períodos cotizados;
• beneficios futuros vinculados a años de cotización;
• cálculos de nuevos subsidios cuando existen licencias posteriores.

Por eso una diferencia previsional durante una licencia prolongada no debería dejarse sin revisar.

Qué información puede cambiar con el tiempo

Algunos principios generales sobre licencias y cotizaciones tienen larga vigencia, pero existen datos que deben verificarse periódicamente.

Entre ellos se encuentran:

• tope imponible mensual;
• comisiones cobradas por las AFP;
• tasas de determinadas cotizaciones del empleador;
• gradualidad del Seguro Social Previsional;
• porcentaje de Cotización con Rentabilidad Protegida;
• procedimientos administrativos electrónicos;
• formas de contacto y plataformas de consulta;
• precios y condiciones contractuales de planes de Isapre.

Por esta razón, si necesita reconstruir una licencia ocurrida varios años atrás, debe utilizar las tasas que estaban vigentes durante ese período y no las actuales.

Fuentes oficiales recomendadas para verificar la información

Para información normativa y actualizaciones relacionadas con licencias médicas y cotizaciones, se recomienda priorizar los siguientes organismos:

• Superintendencia de Seguridad Social.
• ChileAtiende.
• Superintendencia de Pensiones.
• Subsecretaría de Previsión Social.
• Superintendencia de Salud.
• Administradora de Fondos de Cesantía.
• Fonasa.
• Instituto de Seguridad Laboral.

Ante cualquier diferencia entre una simulación personal y los montos informados oficialmente, conviene solicitar el detalle de cálculo antes de asumir que existe un error.

Conclusión

Las cotizaciones durante una licencia médica en Chile no desaparecen simplemente porque la persona deje temporalmente de trabajar. El sistema distribuye las responsabilidades entre la entidad pagadora del Subsidio por Incapacidad Laboral y el empleador, dependiendo del tipo de cotización, del contrato, del origen de la incapacidad y del período involucrado.

Para pensión y salud, la referencia general utilizada durante el período de incapacidad es la última remuneración o renta imponible del mes anterior al inicio del reposo, y no necesariamente el monto del subsidio líquido recibido. Esta diferencia explica muchas de las dudas que surgen al comparar liquidaciones de licencia con cartolas de AFP o salud.

En contratos indefinidos también debe considerarse la distribución del Seguro de Cesantía. Durante el período subsidiado, la entidad pagadora asume la cotización de cargo del trabajador cuando corresponde, mientras el empleador continúa pagando su parte.

Además, desde agosto de 2026 deben incorporarse correctamente las nuevas cotizaciones previsionales establecidas por la reforma. Para las remuneraciones de agosto de 2026, la gradualidad contempla un 0,1% destinado a la cuenta individual, un 0,9% de Cotización con Rentabilidad Protegida y un componente de 2,5% asociado al Seguro Social Previsional. Estos porcentajes cambian progresivamente en años posteriores, por lo que siempre debe utilizarse la tasa correspondiente al período exacto que se analiza.

Cuando una licencia cubre solo parte del mes, pueden coexistir cotizaciones pagadas por el empleador y por la entidad responsable del subsidio. Esto es normal y no debe confundirse automáticamente con una duplicidad.

También es importante recordar que una licencia corta puede tener días de carencia para el pago del subsidio sin que esos días necesariamente queden sin cobertura previsional. Del mismo modo, una licencia rechazada, reducida, continuada o calificada como laboral puede requerir un análisis diferente.

Si existen dudas, la forma más segura de revisar la situación es reunir la liquidación de sueldo anterior al reposo, las resoluciones de las licencias, el detalle del SIL, la cartola de AFP, las cotizaciones de salud y el registro del Seguro de Cesantía. Con esos antecedentes puede determinarse qué institución debía efectuar cada pago.

Finalmente, debido a que las tasas previsionales, topes imponibles y mecanismos de implementación pueden cambiar, conviene confirmar siempre los valores vigentes en los canales oficiales de SUSESO, Superintendencia de Pensiones, ChileAtiende, Superintendencia de Salud, AFC y la institución responsable de la licencia antes de efectuar un reclamo o tomar decisiones basadas únicamente en un cálculo manual.